Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms