Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VBP1P61758 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VBP1P61758 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VBP1P61758 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VBP1P61758 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VBP1P61758 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms