Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms