Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL2P60520 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL2P60520 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms