Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME5P56597 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME5P56597 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME5P56597 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME5P56597 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME5P56597 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME5P56597 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME5P56597 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME5P56597 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME5P56597 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME5P56597 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME5P56597 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME5P56597 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME5P56597 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME5P56597 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME5P56597 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME5P56597 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME5P56597 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME5P56597 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME5P56597 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME5P56597 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME5P56597 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME5P56597 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME5P56597 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME5P56597 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME5P56597 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME5P56597 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME5P56597 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME5P56597 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME5P56597 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME5P56597 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME5P56597 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME5P56597 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME5P56597 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME5P56597 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME5P56597 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME5P56597 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NME5P56597 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NME5P56597 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME5P56597 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME5P56597 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME5P56597 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME5P56597 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME5P56597 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME5P56597 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME5P56597 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME5P56597 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME5P56597 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME5P56597 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME5P56597 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME5P56597 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME5P56597 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME5P56597 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME5P56597 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME5P56597 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NME5P56597 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME5P56597 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME5P56597 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME5P56597 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME5P56597 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME5P56597 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME5P56597 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms