Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC13P55735 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC13P55735 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC13P55735 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC13P55735 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC13P55735 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC13P55735 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC13P55735 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC13P55735 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC13P55735 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC13P55735 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC13P55735 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC13P55735 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC13P55735 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC13P55735 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC13P55735 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC13P55735 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC13P55735 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC13P55735 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC13P55735 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC13P55735 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC13P55735 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC13P55735 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC13P55735 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC13P55735 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC13P55735 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC13P55735 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms