Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms