Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms