Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms