Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARSP54136 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARSP54136 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARSP54136 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARSP54136 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARSP54136 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARSP54136 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RARSP54136 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARSP54136 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARSP54136 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARSP54136 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARSP54136 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARSP54136 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARSP54136 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARSP54136 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARSP54136 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARSP54136 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARSP54136 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARSP54136 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARSP54136 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARSP54136 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARSP54136 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARSP54136 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARSP54136 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARSP54136 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARSP54136 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARSP54136 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RARSP54136 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARSP54136 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARSP54136 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARSP54136 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARSP54136 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARSP54136 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARSP54136 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARSP54136 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARSP54136 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARSP54136 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARSP54136 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARSP54136 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARSP54136 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARSP54136 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARSP54136 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARSP54136 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARSP54136 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARSP54136 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARSP54136 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARSP54136 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RARSP54136 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RARSP54136 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARSP54136 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARSP54136 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARSP54136 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARSP54136 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARSP54136 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARSP54136 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARSP54136 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARSP54136 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARSP54136 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARSP54136 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARSP54136 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARSP54136 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARSP54136 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARSP54136 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARSP54136 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARSP54136 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARSP54136 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARSP54136 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARSP54136 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARSP54136 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARSP54136 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARSP54136 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARSP54136 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARSP54136 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARSP54136 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARSP54136 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARSP54136 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARSP54136 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARSP54136 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARSP54136 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARSP54136 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARSP54136 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RARSP54136 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARSP54136 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARSP54136 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms