Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFIP2P53365 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFIP2P53365 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFIP2P53365 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFIP2P53365 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFIP2P53365 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFIP2P53365 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP2P53365 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms