Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP98P52948 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP98P52948 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP98P52948 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP98P52948 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP98P52948 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP98P52948 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP98P52948 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP98P52948 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP98P52948 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP98P52948 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP98P52948 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP98P52948 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP98P52948 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP98P52948 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP98P52948 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP98P52948 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP98P52948 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP98P52948 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP98P52948 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP98P52948 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP98P52948 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP98P52948 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP98P52948 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP98P52948 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP98P52948 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP98P52948 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP98P52948 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP98P52948 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP98P52948 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP98P52948 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP98P52948 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP98P52948 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP98P52948 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP98P52948 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP98P52948 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP98P52948 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP98P52948 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP98P52948 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP98P52948 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP98P52948 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP98P52948 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP98P52948 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP98P52948 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP98P52948 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP98P52948 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP98P52948 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP98P52948 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP98P52948 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP98P52948 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP98P52948 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP98P52948 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP98P52948 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP98P52948 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP98P52948 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP98P52948 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP98P52948 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP98P52948 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP98P52948 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP98P52948 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP98P52948 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP98P52948 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP98P52948 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP98P52948 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP98P52948 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms