Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LUMP51884 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LUMP51884 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LUMP51884 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LUMP51884 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LUMP51884 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LUMP51884 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LUMP51884 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LUMP51884 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LUMP51884 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LUMP51884 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LUMP51884 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LUMP51884 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LUMP51884 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LUMP51884 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LUMP51884 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LUMP51884 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LUMP51884 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LUMP51884 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LUMP51884 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LUMP51884 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LUMP51884 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LUMP51884 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LUMP51884 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LUMP51884 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LUMP51884 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LUMP51884 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms