Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNN1GP51170 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms