Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP3P50461 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSRP3P50461 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms