Protein–RNA interactions for Protein: P49763

PGF, Placenta growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGFP49763 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGFP49763 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGFP49763 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGFP49763 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGFP49763 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGFP49763 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGFP49763 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGFP49763 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGFP49763 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGFP49763 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGFP49763 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGFP49763 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGFP49763 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGFP49763 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGFP49763 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGFP49763 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGFP49763 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGFP49763 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PGFP49763 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGFP49763 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGFP49763 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGFP49763 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGFP49763 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGFP49763 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGFP49763 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGFP49763 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGFP49763 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGFP49763 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGFP49763 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGFP49763 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGFP49763 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGFP49763 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGFP49763 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGFP49763 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGFP49763 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGFP49763 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGFP49763 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGFP49763 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGFP49763 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGFP49763 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGFP49763 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGFP49763 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGFP49763 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGFP49763 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGFP49763 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGFP49763 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGFP49763 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGFP49763 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGFP49763 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGFP49763 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms