Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA1P49639 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms