Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLCP48506 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLCP48506 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLCP48506 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLCP48506 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLCP48506 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLCP48506 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLCP48506 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLCP48506 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLCP48506 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLCP48506 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLCP48506 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLCP48506 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLCP48506 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLCP48506 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLCP48506 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLCP48506 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLCP48506 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLCP48506 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLCP48506 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLCP48506 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLCP48506 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLCP48506 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLCP48506 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLCP48506 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLCP48506 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLCP48506 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLCP48506 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLCP48506 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLCP48506 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLCP48506 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLCP48506 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLCP48506 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLCP48506 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLCP48506 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLCP48506 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLCP48506 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLCP48506 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLCP48506 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLCP48506 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLCP48506 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLCP48506 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLCP48506 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCLCP48506 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCLCP48506 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCLCP48506 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLCP48506 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLCP48506 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLCP48506 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLCP48506 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLCP48506 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLCP48506 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLCP48506 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLCP48506 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLCP48506 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLCP48506 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLCP48506 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLCP48506 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLCP48506 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLCP48506 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLCP48506 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLCP48506 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLCP48506 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLCP48506 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLCP48506 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLCP48506 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLCP48506 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLCP48506 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLCP48506 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLCP48506 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLCP48506 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLCP48506 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLCP48506 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLCP48506 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLCP48506 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLCP48506 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms