Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNT3P45378 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms