Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR1P43307 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSR1P43307 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSR1P43307 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSR1P43307 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSR1P43307 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSR1P43307 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSR1P43307 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSR1P43307 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSR1P43307 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR1P43307 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR1P43307 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR1P43307 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR1P43307 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR1P43307 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR1P43307 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR1P43307 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR1P43307 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR1P43307 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR1P43307 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR1P43307 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSR1P43307 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSR1P43307 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSR1P43307 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSR1P43307 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSR1P43307 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSR1P43307 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSR1P43307 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSR1P43307 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSR1P43307 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR1P43307 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR1P43307 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR1P43307 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR1P43307 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR1P43307 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR1P43307 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR1P43307 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR1P43307 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR1P43307 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR1P43307 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR1P43307 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR1P43307 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR1P43307 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR1P43307 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR1P43307 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR1P43307 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR1P43307 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR1P43307 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR1P43307 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms