Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HTTP42858 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HTTP42858 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HTTP42858 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTTP42858 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTTP42858 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTTP42858 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTTP42858 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTTP42858 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTTP42858 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTTP42858 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTTP42858 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTTP42858 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTTP42858 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTTP42858 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTTP42858 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTTP42858 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTTP42858 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTTP42858 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTTP42858 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTTP42858 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTTP42858 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTTP42858 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTTP42858 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTTP42858 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTTP42858 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTTP42858 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTTP42858 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTTP42858 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HTTP42858 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTTP42858 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTTP42858 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTTP42858 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HTTP42858 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTTP42858 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTTP42858 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTTP42858 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HTTP42858 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTTP42858 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTTP42858 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTTP42858 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTTP42858 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTTP42858 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
HTTP42858 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTTP42858 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTTP42858 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTTP42858 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTTP42858 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTTP42858 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTTP42858 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTTP42858 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTTP42858 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTTP42858 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTTP42858 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTTP42858 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTTP42858 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HTTP42858 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTTP42858 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTTP42858 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTTP42858 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTTP42858 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms