Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms