Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB2P35606 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB2P35606 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB2P35606 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB2P35606 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB2P35606 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB2P35606 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB2P35606 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB2P35606 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB2P35606 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB2P35606 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB2P35606 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB2P35606 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB2P35606 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB2P35606 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB2P35606 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB2P35606 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms