Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC1P35251 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC1P35251 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC1P35251 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC1P35251 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC1P35251 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC1P35251 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC1P35251 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC1P35251 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC1P35251 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC1P35251 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC1P35251 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC1P35251 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC1P35251 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC1P35251 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC1P35251 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC1P35251 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC1P35251 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC1P35251 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFC1P35251 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFC1P35251 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC1P35251 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC1P35251 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC1P35251 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC1P35251 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC1P35251 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC1P35251 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC1P35251 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC1P35251 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC1P35251 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC1P35251 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC1P35251 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC1P35251 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC1P35251 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC1P35251 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC1P35251 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFC1P35251 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFC1P35251 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFC1P35251 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFC1P35251 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFC1P35251 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFC1P35251 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFC1P35251 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFC1P35251 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFC1P35251 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFC1P35251 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFC1P35251 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFC1P35251 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFC1P35251 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFC1P35251 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFC1P35251 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFC1P35251 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFC1P35251 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFC1P35251 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms