Protein–RNA interactions for Protein: P33552

CKS2, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKS2P33552 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKS2P33552 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKS2P33552 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKS2P33552 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKS2P33552 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKS2P33552 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKS2P33552 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKS2P33552 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKS2P33552 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKS2P33552 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKS2P33552 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKS2P33552 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKS2P33552 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKS2P33552 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKS2P33552 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKS2P33552 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKS2P33552 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKS2P33552 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKS2P33552 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKS2P33552 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKS2P33552 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms