Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A5P29400 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms