Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB5P28074 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms