Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGAT1P26572 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms