Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms