Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNE1P24864 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms