Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GADD45AP24522 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GADD45AP24522 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms