Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA6P23229 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms