Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKACBP22694 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms