Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK11BP21127 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms