Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms