Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms