Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF3P18847 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF3P18847 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF3P18847 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF3P18847 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF3P18847 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF3P18847 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF3P18847 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF3P18847 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF3P18847 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF3P18847 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF3P18847 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF3P18847 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF3P18847 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF3P18847 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF3P18847 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF3P18847 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF3P18847 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF3P18847 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF3P18847 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF3P18847 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF3P18847 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF3P18847 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF3P18847 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF3P18847 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF3P18847 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF3P18847 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF3P18847 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF3P18847 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF3P18847 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF3P18847 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF3P18847 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF3P18847 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF3P18847 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF3P18847 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF3P18847 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF3P18847 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF3P18847 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF3P18847 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF3P18847 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF3P18847 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF3P18847 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF3P18847 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF3P18847 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF3P18847 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF3P18847 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF3P18847 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF3P18847 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF3P18847 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF3P18847 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF3P18847 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF3P18847 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF3P18847 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF3P18847 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF3P18847 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF3P18847 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF3P18847 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF3P18847 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF3P18847 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF3P18847 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ATF3P18847 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
ATF3P18847 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATF3P18847 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATF3P18847 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATF3P18847 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATF3P18847 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATF3P18847 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATF3P18847 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF3P18847 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF3P18847 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF3P18847 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF3P18847 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF3P18847 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF3P18847 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF3P18847 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF3P18847 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF3P18847 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF3P18847 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF3P18847 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF3P18847 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF3P18847 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF3P18847 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF3P18847 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF3P18847 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF3P18847 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF3P18847 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF3P18847 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF3P18847 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF3P18847 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF3P18847 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF3P18847 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATF3P18847 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATF3P18847 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATF3P18847 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATF3P18847 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATF3P18847 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATF3P18847 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATF3P18847 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATF3P18847 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ATF3P18847 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms