Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPI1P17947 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPI1P17947 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPI1P17947 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPI1P17947 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPI1P17947 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPI1P17947 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPI1P17947 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPI1P17947 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPI1P17947 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPI1P17947 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPI1P17947 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPI1P17947 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPI1P17947 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPI1P17947 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPI1P17947 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPI1P17947 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPI1P17947 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPI1P17947 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPI1P17947 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPI1P17947 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPI1P17947 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPI1P17947 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPI1P17947 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPI1P17947 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPI1P17947 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPI1P17947 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPI1P17947 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPI1P17947 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPI1P17947 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms