Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XBP1P17861 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XBP1P17861 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XBP1P17861 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XBP1P17861 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XBP1P17861 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XBP1P17861 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XBP1P17861 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XBP1P17861 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XBP1P17861 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XBP1P17861 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XBP1P17861 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XBP1P17861 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XBP1P17861 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XBP1P17861 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XBP1P17861 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XBP1P17861 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XBP1P17861 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XBP1P17861 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XBP1P17861 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
XBP1P17861 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XBP1P17861 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XBP1P17861 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XBP1P17861 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XBP1P17861 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XBP1P17861 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XBP1P17861 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XBP1P17861 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XBP1P17861 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XBP1P17861 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XBP1P17861 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XBP1P17861 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XBP1P17861 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XBP1P17861 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XBP1P17861 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XBP1P17861 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XBP1P17861 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XBP1P17861 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XBP1P17861 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XBP1P17861 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XBP1P17861 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XBP1P17861 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XBP1P17861 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XBP1P17861 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
XBP1P17861 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XBP1P17861 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XBP1P17861 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XBP1P17861 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XBP1P17861 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XBP1P17861 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XBP1P17861 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XBP1P17861 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XBP1P17861 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XBP1P17861 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms