Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms