Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGA1P17096 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms