Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG2P13521 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG2P13521 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG2P13521 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG2P13521 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG2P13521 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG2P13521 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG2P13521 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG2P13521 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG2P13521 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG2P13521 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG2P13521 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG2P13521 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG2P13521 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG2P13521 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG2P13521 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG2P13521 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG2P13521 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG2P13521 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG2P13521 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG2P13521 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG2P13521 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG2P13521 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCG2P13521 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG2P13521 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG2P13521 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG2P13521 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG2P13521 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG2P13521 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG2P13521 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG2P13521 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG2P13521 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG2P13521 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG2P13521 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG2P13521 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG2P13521 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG2P13521 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG2P13521 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG2P13521 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG2P13521 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG2P13521 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG2P13521 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG2P13521 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG2P13521 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG2P13521 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG2P13521 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG2P13521 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG2P13521 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG2P13521 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG2P13521 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG2P13521 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG2P13521 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG2P13521 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG2P13521 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms