Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH1P12830 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH1P12830 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH1P12830 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH1P12830 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH1P12830 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH1P12830 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH1P12830 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH1P12830 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH1P12830 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH1P12830 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH1P12830 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH1P12830 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH1P12830 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH1P12830 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH1P12830 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH1P12830 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH1P12830 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH1P12830 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH1P12830 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH1P12830 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH1P12830 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH1P12830 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH1P12830 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH1P12830 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH1P12830 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH1P12830 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH1P12830 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH1P12830 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH1P12830 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH1P12830 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH1P12830 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH1P12830 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH1P12830 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH1P12830 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH1P12830 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH1P12830 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH1P12830 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH1P12830 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH1P12830 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH1P12830 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH1P12830 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH1P12830 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH1P12830 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH1P12830 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH1P12830 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH1P12830 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH1P12830 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH1P12830 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH1P12830 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH1P12830 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH1P12830 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH1P12830 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH1P12830 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH1P12830 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH1P12830 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH1P12830 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH1P12830 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH1P12830 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH1P12830 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH1P12830 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH1P12830 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH1P12830 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH1P12830 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms