Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARBP10826 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARBP10826 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARBP10826 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARBP10826 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARBP10826 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARBP10826 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARBP10826 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARBP10826 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARBP10826 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARBP10826 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARBP10826 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARBP10826 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARBP10826 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARBP10826 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARBP10826 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARBP10826 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARBP10826 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARBP10826 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARBP10826 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARBP10826 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARBP10826 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARBP10826 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARBP10826 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARBP10826 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARBP10826 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARBP10826 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARBP10826 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARBP10826 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARBP10826 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARBP10826 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARBP10826 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARBP10826 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARBP10826 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RARBP10826 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RARBP10826 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARBP10826 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RARBP10826 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARBP10826 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARBP10826 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARBP10826 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RARBP10826 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RARBP10826 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RARBP10826 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARBP10826 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARBP10826 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARBP10826 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARBP10826 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RARBP10826 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARBP10826 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARBP10826 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARBP10826 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARBP10826 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARBP10826 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARBP10826 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARBP10826 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARBP10826 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARBP10826 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARBP10826 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARBP10826 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARBP10826 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RARBP10826 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARBP10826 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARBP10826 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARBP10826 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARBP10826 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARBP10826 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARBP10826 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms