Protein–RNA interactions for Protein: P0CX20

YRF1-1, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-1P0CX20 KAP95YLR347C 2586 nt2.77□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 MSS116YDR194C 1995 nt2.77□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 MSH3YCR092C 3057 nt2.77□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 TCP1YDR212W 1680 nt2.77□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 ELO3YLR372W 1038 nt2.77□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 SAS2YMR127C 1017 nt2.77□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 YMR310CYMR310C 954 nt2.77□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 RPC40YPR110C 1008 nt2.77□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 CAT8YMR280C 4302 nt2.76□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 RPS11BYBR048W 471 nt2.76□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 STH1YIL126W 4080 nt2.76□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 BRR6YGL247W 594 nt2.75□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 BOS1YLR078C 735 nt2.75□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 DIT1YDR403W 1611 nt2.74□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 NVJ1YHR195W 966 nt2.74□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 ALY1YKR021W 2748 nt2.74□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 SRS2YJL092W 3525 nt2.74□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 CUS1YMR240C 1311 nt2.74□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 YDL041WYDL041W 354 nt2.74□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 YHR095WYHR095W 495 nt2.74□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 PET191YJR034W 327 nt2.74□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 RUF21RUF21 707 nt2.74□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 YSA1YBR111C 696 nt2.74□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 RGA1YOR127W 3024 nt2.73□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 YCR013CYCR013C 648 nt2.73□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 YER133W-AYER133W-A 342 nt2.73□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 ADI1YMR009W 540 nt2.73□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 MEI5YPL121C 669 nt2.73□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 EXO84YBR102C 2262 nt2.73□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 SMP1YBR182C 1359 nt2.72□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 GUK1YDR454C 564 nt2.72□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 MRP8YKL142W 660 nt2.72□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 POS5YPL188W 1245 nt2.72□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 DBP7YKR024C 2229 nt2.72□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 TTI1YKL033W 3117 nt2.72□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 SRG1SRG1 551 nt2.72□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 SWD2YKL018W 990 nt2.72□□□□□ -1.97
YRF1-1P0CX20 RCY1YJL204C 2523 nt2.71□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 SEC6YIL068C 2418 nt2.71□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 RRM3YHR031C 2172 nt2.71□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 YJR111CYJR111C 852 nt2.7□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 PAI3YMR174C 207 nt2.7□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 NAT1YDL040C 2565 nt2.7□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.69□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 TVP18YMR071C 504 nt2.69□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 SQS1YNL224C 2304 nt2.69□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 GLO3YER122C 1482 nt2.69□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 YRB1YDR002W 606 nt2.69□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 CYC1YJR048W 330 nt2.69□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 RCE1YMR274C 948 nt2.69□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 KIN82YCR091W 2163 nt2.68□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 RAD5YLR032W 3510 nt2.68□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 YDR431WYDR431W 312 nt2.68□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.68□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 SGM1YJR134C 2124 nt2.68□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 MIX14YDR031W 366 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 PDX1YGR193C 1233 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 SWC7YLR385C 399 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 MMS1YPR164W 4224 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 ESC1YMR219W 4977 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 SHE4YOR035C 2370 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 ORM1YGR038W 669 nt2.66□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 PEP7YDR323C 1548 nt2.66□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 YDR442WYDR442W 393 nt2.66□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.66□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 YBR287WYBR287W 1284 nt2.66□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 OPT2YPR194C 2634 nt2.66□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 GLN4YOR168W 2430 nt2.66□□□□□ -1.98
YRF1-1P0CX20 TIF35YDR429C 825 nt2.65□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 SPS18YNL204C 903 nt2.65□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 TRM7YBR061C 933 nt2.65□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 BSD2YBR290W 966 nt2.65□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 ADK1YDR226W 669 nt2.64□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 GIS1YDR096W 2685 nt2.64□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 PSK1YAL017W 4071 nt2.64□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 CUS2YNL286W 858 nt2.64□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 NFI1YOR156C 2181 nt2.64□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 STE12YHR084W 2067 nt2.63□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 SUC2YIL162W 1599 nt2.63□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 SPC72YAL047C 1869 nt2.63□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 CAB2YIL083C 1098 nt2.63□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 RPS28BYLR264W 204 nt2.63□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 YLR326WYLR326W 723 nt2.63□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 MFM1YPL060W 1242 nt2.63□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 SIP1YDR422C 2448 nt2.62□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 ALO1YML086C 1581 nt2.62□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 SAE3YHR079C-A 276 nt2.62□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 YHC1YLR298C 696 nt2.62□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 YBR300CYBR300C 498 nt2.62□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 TPD3YAL016W 1908 nt2.62□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 PEX17YNL214W 600 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 HEM4YOR278W 828 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 YNL144CYNL144C 2223 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 PUT2YHR037W 1728 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 UBP12YJL197W 3765 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 FAF1YIL019W 1041 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 ARF3YOR094W 552 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 MGA2YIR033W 3342 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 SAT4YCR008W 1812 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-1P0CX20 ECM29YHL030W 5607 nt2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.5 ms