Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM228BP0C875 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms