Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L7P0C7H9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms