Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms