Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYBBP04839 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYBBP04839 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYBBP04839 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CYBBP04839 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYBBP04839 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYBBP04839 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYBBP04839 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYBBP04839 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYBBP04839 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYBBP04839 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYBBP04839 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYBBP04839 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYBBP04839 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYBBP04839 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYBBP04839 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYBBP04839 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYBBP04839 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYBBP04839 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYBBP04839 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CYBBP04839 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYBBP04839 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms