Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC3P02656 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC3P02656 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC3P02656 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOC3P02656 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOC3P02656 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOC3P02656 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOC3P02656 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOC3P02656 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC3P02656 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC3P02656 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC3P02656 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC3P02656 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC3P02656 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC3P02656 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC3P02656 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC3P02656 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC3P02656 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC3P02656 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC3P02656 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC3P02656 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC3P02656 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC3P02656 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC3P02656 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC3P02656 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC3P02656 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC3P02656 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC3P02656 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC3P02656 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC3P02656 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms